Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim38Q5SZ99 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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Trim38Q5SZ99 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Trim38Q5SZ99 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Trim38Q5SZ99 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim38Q5SZ99 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim38Q5SZ99 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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