Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fam46cQ5SSF7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam46cQ5SSF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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