Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc85aQ5SP85 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc85aQ5SP85 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc85aQ5SP85 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms