Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlha9Q5RJB0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms