Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv4Q5R1A3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdv4Q5R1A3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms