Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtp3Q5QGU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms