Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm6bQ5NCY0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm6bQ5NCY0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms