Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Trim41Q5NCC3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Trim41Q5NCC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Trim41Q5NCC3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Trim41Q5NCC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trim41Q5NCC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms