Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vps41Q5KU39 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vps41Q5KU39 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms