Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp28Q5I043 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp28Q5I043 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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