Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hs3st6Q5GFD5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hs3st6Q5GFD5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms