Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ecm2Q5FW85 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ecm2Q5FW85 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ecm2Q5FW85 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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