Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp22Q5DU02 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp22Q5DU02 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms