Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fam208bQ5DTT3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fam208bQ5DTT3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam208bQ5DTT3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms