Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spire1Q52KF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms