Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rtl6Q505G4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rtl6Q505G4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rtl6Q505G4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl6Q505G4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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