Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trappc3lQ4KL14 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms