Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shank3Q4ACU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shank3Q4ACU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms