Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brinp3Q499E0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms