Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx25Q3ZT31 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Snx25Q3ZT31 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Snx25Q3ZT31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Snx25Q3ZT31 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Snx25Q3ZT31 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Snx25Q3ZT31 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Snx25Q3ZT31 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snx25Q3ZT31 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snx25Q3ZT31 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms