Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ckap2Q3V1H1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2Q3V1H1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms