Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc43Q3V0L5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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