Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrfip1Q3UZ39 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms