Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnaaf3Q3UYV8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnaaf3Q3UYV8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms