Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc114Q3UX62 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc114Q3UX62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms