Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn13Q3UW68 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn13Q3UW68 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn13Q3UW68 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms