Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Defb48Q3UW22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defb48Q3UW22 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defb48Q3UW22 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defb48Q3UW22 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defb48Q3UW22 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defb48Q3UW22 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defb48Q3UW22 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms