Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga4Q3UW12 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cnga4Q3UW12 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms