Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb2Q3UUV9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms