Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BB287469Q3UT53 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BB287469Q3UT53 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms