Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28047Q3US59 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms