Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf48Q3US17 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms