Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwa5b2Q3UR50 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms