Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQH6

Gm5127, Predicted gene 5127, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5127Q3UQH6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5127Q3UQH6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5127Q3UQH6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5127Q3UQH6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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