Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Elf3Q3UPW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Elf3Q3UPW2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Elf3Q3UPW2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms