Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdgfl2Q3UMU9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms