Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cobll1Q3UMF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cobll1Q3UMF0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms