Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnep1r1Q3UJ81 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnep1r1Q3UJ81 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms