Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rsph3aQ3UFY4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms