Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Puf60Q3UEB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Puf60Q3UEB3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Puf60Q3UEB3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms