Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip13Q3UA06 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms