Protein–RNA interactions for Protein: Q3U829

Ap5z1, AP-5 complex subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5z1Q3U829 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5z1Q3U829 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5z1Q3U829 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5z1Q3U829 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5z1Q3U829 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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Ap5z1Q3U829 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ap5z1Q3U829 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5z1Q3U829 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5z1Q3U829 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Ap5z1Q3U829 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms