Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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