Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VwceQ3U515 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VwceQ3U515 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms