Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud5Q3U2S4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud5Q3U2S4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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