Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms