Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem88bQ3TYP4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem88bQ3TYP4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms