Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmtk2Q3TYD6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmtk2Q3TYD6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmtk2Q3TYD6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmtk2Q3TYD6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms