Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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