Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Fndc4Q3TR08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fndc4Q3TR08 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fndc4Q3TR08 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fndc4Q3TR08 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc4Q3TR08 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Fndc4Q3TR08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Fndc4Q3TR08 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc4Q3TR08 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms